医生在自己工作单位开具的伤情鉴定证明是否有效，主要取决于该医生是否具有相应的执业资格以及该证明是否符合相关法律法规的规定。

医生执业资格：

伤情鉴定必须由具有执业资格的医生出具，这样的医生通常是在卫生行政主管部门许可的医疗机构工作。

证明用途：

该证明可以作为公安机关认定人身伤害程度的依据，但前提是必须符合特定的法律程序和要求。

避免重复鉴定：

如果公安部门已经委托了鉴定机构进行鉴定，那么建议不再委托其他单位进行鉴定，以确保鉴定结果的一致性和权威性。

法律效力：

在特定情况下，如普通民事纠纷或轻微刑事案件中，自己去医院进行的伤情鉴定可能会被法院等司法机关采纳为证据。

综上所述，如果医生是在其工作单位（且该单位是卫生行政主管部门许可的医疗机构）具有执业资格的医生，并且按照相关法律法规和程序开具了伤情鉴定证明，那么该证明在特定情况下是有效的。然而，在涉及重大刑事案件或需要专业司法鉴定机构进行鉴定的情况下，仅凭此证明可能不会被认可，因为司法鉴定机构通常具备更为专业的设备和技术，其出具的鉴定结果更具权威性。

因此，建议在需要伤情鉴定时，尽量选择具有专业资质和设备的司法鉴定机构进行鉴定，以确保鉴定结果的法律效力。