取消考试扣分的原因主要有以下几点：

考试机会减少：

取消考试等同于失去了一次考试机会，因此会扣除相应的分数。例如，取消科目三考试会减少一次考试机会，从而减一分。

直接算作挂科：

有些情况下，取消预约会被直接算作考试挂科。这意味着不仅会扣除分数，还可能需要重新预约并支付补考费用。

违规行为：

如果在考试过程中有违规作弊行为，车管所有可能取消考试成绩，并扣除相应的分数。

无法联系取消预约：

如果因为某些原因无法联系到车管所取消预约，车管所可能会自动取消预约并扣分。这种情况下，扣分对以后的考试成绩没有影响。

建议

提前取消预约：如果确实需要取消考试，最好提前联系车管所进行取消，以避免因未及时取消而扣分。

选择合适的时间：在预约考试时，应选择合适的时间，确保当天没有其他事情，可以安心考试，以免因缺考而错失机会并扣分。

遵守规定：在考试过程中应遵守相关规定，避免违规行为，以免被取消考试成绩并扣分。

希望这些信息对你有所帮助。