鸣人未能通过中忍考试的主要原因如下：

使用禁止的仙人模式

在2018年中忍考试期间，鸣人因违反考试规则使用被禁止的仙人模式而被取消考试资格。这是他未能通过考试的最直接原因。

考试中断

考试进行到一半时，大蛇丸发动攻击打断了考试进程，导致考试无法完成。虽然鸣人最终打败了木叶丸，但考试已无法继续。

后续发展影响

- 鸣人因追佐助离开考场；

- 与自来也修行期间未参加考试；

- 中忍考试名额限制（仅鹿丸一人晋级）。

综上，鸣人未能通过中忍考试的核心原因是规则违规和考试中断，而后续发展进一步导致他未能完成考试。