选择在早上考科目二的原因主要有以下几点：

思维灵敏，大脑清醒：

早上人的思维比较灵敏，大脑比较清醒，身体各方面都比较协调。这样在考试中能够更好地集中注意力，操作也会更加灵活。

身体状态良好：

早上的身体状态通常比中午或下午要好，不容易出现疲劳或瞌睡的情况，从而能够更稳定地完成考试项目。

天气凉爽：

早上的天气相对凉爽，能够保持较好的身体状态，避免因高温引发的烦躁或不适。

减少等待时间：

如果安排在下午考试，学员需要等待较长时间，容易产生焦虑和紧张情绪，影响考试表现。而早上考试则可以避免这一问题，使学员能够更早地开始考试。

提高通过率：

根据教练的经验和学员的反馈，早上考科目二的通过率相对较高，因为学员在早上的状态更好，能够更好地应对考试中的各种情况。

综上所述，选择在早上考科目二有助于提高学员的考试表现和通过率，同时也能减少等待时间和焦虑情绪。因此，建议学员尽量选择早上进行科目二考试。